La muzikaj instrumentoj kiuj kontribuas al la aparta sono de makedona popolmuziko estas diversaj kaj buntaj. Pli malnovaj kaj tradiciaj instrumentoj kiel la gaido (гајда, sakŝalmo), la kavalo (кавал, fluto), la tapano (тапан, dukapa bastamburo), kaj la tamburao (longokola speco de liuto) estas uzataj kun pli nuntempaj instrumentoj.